به گزارش روابط عمومی سازمان حج و زیارت در متن پیام تسلیت علی رضا رشیدیان آمده است: 

بسم الله الرحمن الرحیم
الَّذِينَ إِذَا أَصَابَتْهُم مُّصِيبَةٌ قَالُواْ إِنَّا لِلّهِ وَإِنَّا إِلَيْهِ رَاجِعونَ

ضایعه ارتحال فقیه جلیل القدر، عالم خدمتگزار، مردمی، وارسته و متعهد و شخصیتی ممتاز در علم و اخلاق، حضرت آیت الله محمدمهدی موسوی خلخالی از مفاخر برجسته و اعاظم حوزه های علمیه که سال های با برکت عمر را مصروف تألیف، تدریس، تعلیم و تربیت طلاب و تهذیب نفس و ترویج فرهنگ و معارف نورانی اسلام و اهل بیت علیهم السلام نمودند و با تربیت شاگردان مبرز و فاضل به خواست الهی توانستند منشأ خدمات شایانی به دین و قرآن و عترت و معنویت و مهدویت باشند؛ موجب اندوه و تأسف فراوان است.
این مصیبت را در کمال خضوع به محضر مبارک امام عصر(عج) و خاندان مکرم آن اندیشمند ربانی و شاگردان و ارادتمندان ایشان و عموم مجاورین امام رئوف(ع) تسلیت گفته و از درگاه خداوند قادر متعال برای آن فقید سعید علو درجات و برای بازماندگان صبر و اجر مسألت دارم.